De Transformatorer filmserien var et vendepunkt i Megan Foxs karriere. Det var den største rollen hun landet i sin spirende vei til stjernestatus og virket som om det ville føre henne til en permanent plassering på Hollywood A-listen. Fox forlot imidlertid serien etter den andre filmen.
Fox spilte Mikaela Banes, elsker interesse for Shia LaBeoufs Sam i den Michael Bay-regisserte filmen. De to kjempet side om side med Autobots da de onde Decepticons forlot hjemplaneten og truet jordens velvære. På slutten av den andre filmen erklærte Mikaela og Sam sin kjærlighet til hverandre. Men av Transformers: Dark of the Moon , Sam var sammen med en ny jente ved navn Carly (Rosie Huntington-Whiteley), og Foxs karakter var fraværende.
Michael Bay har aldri hatt et sterkt rykte som Hollywood-regissør; han har blitt beskyldt for å være unødvendig krevende med rollebesetningen og mannskapet på hvert sett. I et 2009-intervju med Wonderland Magazine , Fox gikk beryktet på platen og sprengte Bay. Hun fortalte publikasjonen at Bay ønsket å opprettholde sitt krevende rykte og slått ned på settet, og gikk så langt som å sammenligne ham med Hitler. I følge Kosmopolitisk , Spielberg , som var produsent på Transformator serie, fikk tak i kommentaren og foreslår at Bay fyrer henne.
I 2011 GQ intervjufremmende Den mørke siden av månen , svarte regissøren på kommentarene hennes ved i det vesentlige å pusse dem av. Han sa at Fox likte å få en økning i folk, og gjorde det alltid på feil måte. Bay forsvarte seg og sa at han bare krevde at skuespillerne skulle møte opp i tide og av og til jobbe lange dager på settet.
Etter å ha blitt sparket, ble Fox noe av en pariah i Hollywood i en periode. I Kosmopolitisk intervju delte Fox sin angring på oppførselen og sa at det var det laveste punktet i karrieren hennes. Hun var ung - bare 23 - og trodde at hennes handlinger var rettferdige. Men når jeg ser tilbake, sier hun at det var en massiv læringsopplevelse som satte karrieren hennes på en helt annen bane enn den hun tidligere var på. I stedet for å bli A-Lister mange trodde hun ville være, slo Fox seg inn i en mer avslappet karriere. Hun hadde en birolle i Judd Apatow Dette er 40 og en tilbakevendende rolle i hit sitcom Nye jenten . Men hvis hendelsen med Bay aldri hadde skjedd, er det mulig at Fox ville ha fått flere ledende roller i filmer og TV-serier.
Megan Foxs erfaring skraper bare overflaten av de mørke elementene i å jobbe i Hollywood - en feil og en skuespiller kan kastes ut. Men sølvfôret er at Fox lærte av fortiden og virker i fred med hvor karrieren hennes er. Tilfeldigvis fortsatte Fox og Bay å jobbe sammen igjen, om enn på en indirekte måte. Fox spilte en rolle i omstart Teenage Mutant Ninja Turtles film, som ble produsert av Bay.