De Assassin's Creed franchise har alltid fortalt sin historie fra perspektivet på Assassin Order. Med Templarordenen som kjemper for fred gjennom fjerning av fri vilje, har det alltid vært klart hvem som har rett. Imidlertid er det en tittel som viste frem perspektivet av Templarordenen - og hvordan en turncoat nesten ødela Assassins Colonial Brotherhood.
Assassin's Creed Rogue introduserte en ung snikmorder ved navn Shay Patrick Cormac, som var medlem av det amerikanske brorskapet like før syvårskrigen. Han og vennen Liam O'Brien fikk i oppdrag å jakte på gjenstander som ordenen trodde var knyttet til Edens stykker. Disse eksisterte lenge før trosbekjennelsen ble født og hadde så stor makt at hvis templerne skulle få kontroll over til og med en av dem, kunne de slave hele menneskeheten.
Paret klarte å finne en gjenstand i et gammelt tempel under Lisboa. Imidlertid utløste Shay det et jordskjelv som drepte og strandet tusenvis. Denne erfaringen fikk ham til å tro at leiemorderne ikke bryr seg om uskyldige, og ser nå på dem som det motsatte av heltene han trodde de var. Shay vendte ordren ryggen og satte livet i fare da medarbeidere jaktet ham. Til slutt fant han veien til den koloniale ritualen til Templarordenen, og derfra gikk han på sidemorderenes svorne fiende og lovet å forhindre at hans gamle medarbeidere noen gang fant et annet tempel.
I løpet av syvårskrigen jaktet Shay på sine gamle snikmordspartnere med Templar stormester, Haytham Kenway. Haytham var sønn av piratmorderen Edward Kenway, men han ble oppdratt til å følge templerne. Gjennom årene fikk Haytham og Shay en sterk holdning i koloniene og vant syvårskrigen for tempelridderne. Han eliminerte også noen av de mektigste medlemmene av Colonial Brotherhood.
Høydepunktet av Assassin's Creed Rogue så Shay drepe sin gamle venn Liam og Haytham og lamleste lederen deres, Achilles Davenport. I syv år var leiemorderne uorganiserte og uten ledelse da Shay og tempelridderne kontrollerte koloniene fra skyggen. Det ville ikke ta ytterligere syv år før Haythams sønn Connor ville ankomme og fortsette der Achilles slapp ved å eliminere templar-trusselen i Amerika og hjelpe landets seier mot den britiske kronen under en av historiens viktigste konflikter, den amerikanske revolusjonen.
Cormac fortsatte å jobbe med Templarordenen og jaktet på gamle gjenstander som ville hjelpe dem med å få et forsprang mot morderne. Da Connor fortsatte med å frigjøre koloniene, var Shay i Paris, i oppdrag å drepe en snikmorder som hadde en hellig boks som kunne låse opp gamle hemmeligheter og eksisterte så langt tilbake som den kinesiske snikmorderen Shao Jun. Morderen han drepte var faren til Arno Dorian, en snikmorder som ville hjelpe til med å frigjøre Paris i Assassin's Creed Unity . Selv om Shay Cormac ikke ødela det amerikanske brorskapet av leiemordere, viste han hvor raskt de kunne bryte sammen når en av dem bytter side.
