Captain America: Civil War avslørte mange mørke hemmeligheter rundt noen av filmens fremtredende karakterer. Mens den største avsløringen var at Vintersoldaten (Sebastian Stan) drepte Tony Starks (Robert Downey Jr.) foreldre, var det mange andre avsløringer strødd gjennom hele filmen. For eksempel viste Peggy Carters (Hayley Atwell) død sine egne avsløringer i både teaterklippet og de slettede scenene.
Under begravelsen av Peggy avslørte Sharon Carter (Emily VanCamp) at hun var niesen til Steve Rogers (Chris Evans) gamle flamme, men dette var ikke den eneste familiehemmeligheten som helten ble gjort oppmerksom på. Da han tilbrakte tid alene i kirken og behandlet Peggys død, gikk Natasha Romanoff (Scarlett Johansson) inn for å forsikre seg om at venninnen ikke var alene. Mens teatralsk klippingen var en kort samtale som var knyttet til hvem som hadde og ikke hadde signert Sokovia-avtalen, inneholdt en slettet scene en stor del av Black Widows fortid.
På scenen snakket Steve om hvordan han var overrasket over at Peggy fortsatt var i live etter at han kom ut av isen. Natasha minnet ham om hvor viktig det også var for Peggy at de to klarte å koble til igjen mens det fortsatt var tid. Nat forklarte også hvordan hennes beslutning om å forsvinne og finne en ny identitet etter hendelsene i Captain America: The Winter Soldier knyttet til hvordan Steve hadde det.
Etter at S.H.I.E.L.D. kollapset, bestemte Natasha seg for å oppdage mer om familien sin. Den slettede scenen, 'Extended Peggy's Funeral', dykket mer inn i sannheten om foreldrenes skjebne. Som hun forklarte, førte Nats søk henne til to gravsteiner ved et kjettingleddgjerde. I en form for lukking trakk Nat litt ugress og la igjen blomster på gravstedet. Hun avsluttet historien sin med å minne Steve om at 'vi har det vi har når vi har det.'
Nats karakter var bygget på tap og utholdenhet. Hun mistet en familie i Vintersoldaten når S.H.I.E.L.D. ble demontert, men hun støttet seg på Avengers som et annet hjem som hun kunne sette krav på. Hun minnet Steve om at det viktige var tiden han hadde med menneskene han elsket, som Nat aldri fikk med foreldrene sine. Med Sokovia-avtalen ble hennes familie truet igjen og uunngåelig splittet ned i midten. Til slutt, hennes død i Avengers: Endgame var noe som bidro til å bringe dem sammen igjen.
Captain America: Civil War viste at Black Widows sanne troskap lå hos familien hennes. Hennes beslutning om å bytte side i tredje akt fungerte som et godt eksempel på det. Imidlertid bidro den slettede scenen der hun diskuterte sine avdøde foreldre, med å legge til et nytt lag i fokuset hennes på familien, mens hun også varslet omslaget senere i filmen. Dessverre er Marvel Cinematic Universes slettede scener ikke ansett som kanon, så det er uklart om denne informasjonen vil overføres til hovedkontinuiteten.
