De X menn har endret seg mye de siste årene med publisering, med Krakoa-tiden som kanskje den største utviklingen til nå. Ved å ta underdog-mutantene og heve dem over enhver annen gruppe i Marvel-universet, er den opphevede status quo absolutt annerledes enn det de har blitt vant til. For så store som disse skiftene er, har de røtter i en av de beste X menn løper noensinne.
Nye X-Men fra Grant Morrison og Frank Quitely er fortsatt blant de mest vellykkede (og omstridte) kjøringene på Marvels mutanter. Det gikk utover bare superhelter å leke med ideer om mutant identitet, politikk og motkultur på en måte som ikke har blitt berørt igjen før Krakoa-tiden. Nå over 20 år gammel var denne landemerkeserien et forutseende tegn på ting som skulle komme.
Nye X-Men Endret Status Quo før Huset til X

Fra og med 2001, Nye X-Men var et stort skifte i det X-Men hadde blitt kjent for. Gjennom deres suksess på 90-tallet , de var ansiktet til bombastiske og høytselgende tegneserier, og energien deres var synonymt med typen som finnes i Image Comics. Tidene endret seg imidlertid inn i 2000-tallet, og den samme gamle status quo ville rett og slett ikke være nok. Revolusjonsfornyelsen var en fiasko , og med suksessen til det jordete og idiosynkratiske 2000 X menn film, det var på tide med en forandring. Det er her Morrison og Quitely's Nye X-Men kom inn, med sine svarte skinnkostymer og høykonsept sci-fi-temaer som et avvik fra typiske X-Men-bøker. Den sentrale ideen til stede i løpet var den om mutant identitet og hva det betydde å være en mutant. Morrisons forfatterskap så at ting gikk utover bare å gjøre mutantene til en undertrykt gruppe og omfavnet virkelig alle aspekter ved å være en minoritetsgruppe.
Mutantkultur begynte å bli vist frem, og hurtigheten som den blir kommersialisert og utnyttet for massene representerer hva som er gjort med mange andre minoritetskulturelle artefakter. Apropos det, mutantenes natur er co-optert og tilegnet seg av 'U-Men', som brukte mutante kroppsdeler for å oppnå sine egne overmenneskelige evner og bli en 'ny art.' Unødvendig å si, presentasjonen og historiefortellingen fra Jim Lee-tiden var borte, med Nye X-Men nesten skiller ting fra Marvel-universet egentlig. Noen av disse endringene var kontroversielle, spesielt ettersom de ville forholde seg til Magneto/Xorn. Likevel viste boken seg å være en hit, selv om påfølgende kjøringer nesten umiddelbart ville angre gevinsten den ga for eiendommen. Med Krakoa-æraen omfavner X-Men endelig høsten som Morrison hadde plantet for så mange år siden.
Jonathan Hickmans X menn Gjenopprettet Grant Morrisons ideer

Nå, med Krakoa-æraen, har mutantene tatt øya Krakoa og laget seg en plass i Marvel-universet, fri fra lenkene til menneskelig undertrykkelse. Dette gjør dem i hovedsak til den dominerende arten på jorden, som faktisk gjenoppstår en forutsett fremtid hvor mutanter vil vokse for å erstatte menneskeheten. Den ideen ble introdusert i Morrison/Quitely's Nye X-Men , og det er ikke den eneste ideen som dukker opp igjen i moderne tid. Forutsetningen for mutant identitet blir nok en gang lekt med, ettersom det å være en mutant (eller gift med en) kreves for å få adgang til Krakoa. For en gruppe unge supermennesker som modellerte seg etter klassiske X-Men (The Children of the Atom), oppveide deres ønske om å være mutanter deres genetiske virkelighet. Dette førte også tilbake temaer om appropriasjon til kampen, spesielt i dagens politiske klima.
Mutantenes fiender Sentinels er også brakt tilbake i disse løpene og endret for å gjenspeile den mer robuste naturen til Homo Superior, slik at ting ikke bare gjentar fortiden. Krakoa har sin egen kultur og til og med sin egen religion , noe som gjør mutanter virkelig til en verden for seg selv. Dette bygger på den mutante motkulturen som ble brakt inn under Nye X-Men , som nå gjør det analogt med utenlandsk popkultur som blir en hit i Vesten. Til og med ideen om sekundære mutasjoner og lignende endringer kan sammenlignes med oppstandelsesprotokollene til Krakoa, og viser hvordan selve ideen om mutanter er å utvikle seg og bevege seg utover svakhetene til normale mennesker. Morrisons ikoniske løp er nå noen tiår gammelt, og det er først nå at mange av de narrative elementene de begynte i Nye X-Men ser deres logiske utførelse.